细菌完成图是指不需要任何现有序列信息,通过长读长测序以及生物信息学分析手段对得到的细菌物种的完整基因组及质粒序列。相比传统基于二代测序的框架图,细菌完成图可以更加准确、全面的描述细菌基因组的实际组成情况,对于基因功能研究、进化分析、工程菌改造、诊断试剂开发等有着显著价值
星空网页版官方端在线依托前沿纳米孔长读长测序技术,搭配标准化、完善的生物信息学分析流程,可实现一周内精准交付细菌完整基因组及质粒序列,交付效率远超行业常规水平。同时结合自研的基因组提取与建库专用试剂,让客户以高性价比获取高质量的完成图测序结果,助力科研人员开展细菌耐药性、毒力系统、代谢通路、环境适应性及物种进化演变历程等方向的精细化深度研究。
| 服务项目 | 样本类型 | 交付周期(工作日) |
|---|---|---|
| 细菌基因组DNA提取 | 菌体 | 3 |
| 16S污染鉴定 | 基因组DNA | 2 |
| 细菌基因组建库测序 | 基因组DNA | 3 |
| 细菌完成图 | 基因组DNA | 5 |
默认细菌完成图不包含16s 污染鉴定,建议老师送样前首先进行污染排查检测及菌种鉴定,确定物种正确,无其他杂菌污染再送样。
| 总量要求 | 运输方式 |
|---|---|
| 0.5-1g,2-3个备份 | 干冰邮寄 |
- 先富集培养,在对数生长期离心收集菌体,用 1X PBS 洗 1-2 次,去除培养基
- 菌体量 0.5-1mL(0.5-1g)起送,送 2-3 个平行备份;
- 用 1.5mL 离心管,做好标记,和录单名称保持一致;
- 液氮速冻 10min 以上,自封袋装好样品和信息单,干冰送样;
- 菌体平行备份样本,如需分开质检,则需-1 -2 -3 区别标注并录单;如果不分开质检,则需在备注里标注可将样本混合后提取质检。。
- 注意:
- a. 不要送平板和带液体培养基的,会默认为不合格样品;
- b. 一定是生长对数期的新鲜菌体,否则可能会存在未知的基因组 DNA 损伤或 DNA 降解,导致测序质量下降;
- c. 细菌得率有高有低,组织量送得太少会导致提取失败;
- d. 避免送含有致病性的病原体,部分危险等级分类为三级病原需要灭活后送检。由于革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌处理方式不同,故细菌样本能提供物种名,需告知物种名;若不能告知物种名,需告知是革兰氏阴性还是阳性菌。
| 总量要求 | 运输方式 |
|---|---|
|
a. DNA 总量≥5 μg,浓度≥50 ng/μL; b. OD260/280= 1.8~2.0,OD260/230= 1.6~2.4; c. 基因组无严重降解,主带≥10 kb ,无弥散条带 |
干冰邮寄 |
- DNA 总量≥5 μg,浓度≥50 ng/μL,OD260/280= 1.8~2.0, OD260/230= 1.6~2.4;
- 无杂质污染(DNA 溶液无色素、无悬浮物、不粘稠,无 RNA 、蛋白、糖类等杂质污染);
- 基因组无严重降解,主带≥10 kb ,无弥散条带;
- 基因组 DNA 平行备份样本,如需分开质检,则需-1 -2 -3 区别标注并录单;如果不分开质检,则需在备注里标注可将样本混合后质检。
- 注意:
总量不足 5 μg 样本无法进行片段筛选,可能会导致测序质量差,星空网页版官方端在线无法保证测序片段长度及组装效果
400-0688-426
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